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国际首个兰科藤本植物完成基因组测序

作者:habao 来源:未知 日期:2020-4-22 9:11:47 人气: 标签:中国兰科植物网
导读:梦见假牙掉了据了解,香荚兰(Vanillasp。)为兰科香荚兰属植物,又名香子兰、香草兰、香草、香兰,是典型的热带雨林中的一种大型兰科香料植物,并因其独特而无法人…

  梦见假牙掉了据了解,香荚兰(Vanillasp。)为兰科香荚兰属植物,又名香子兰、香草兰、香草、香兰,是典型的热带雨林中的一种大型兰科香料植物,并因其独特而无法人工合成的香味,被广泛应用于食品、化妆品、烟草等行业,被誉为“香料皇后”。现今,香荚兰已是仅次于藏红花的世界第二昂贵香料,在美国市场上每公斤香荚兰果荚高达90美元,而且前景广阔,行情看涨。

  福建农林大学校长兰思仁教授介绍,兰科植物占全世界植类10%,是世界性的濒危,是植物界最大和进化程度最高的家族之一,是生物多样性和进化研究以及生物的“旗舰”和理想的模式类群,具有极高的科研、生态、观赏、文化和药用价值,是中国最珍贵的野生植物资源之一。

  兰思仁说,由于目前全球尚未有对香荚兰进行基因组测序及分析的成功案例,而其所在的香荚兰亚科在基因组测序上也仍处于空白状态,福建农林大合国家兰科植质资源中心(深圳)于2014年7月启动了“香荚兰基因组项目”,计划率先对深圳香荚兰进行全基因组测序和生物信息分析,同时对相关种类的组进行测序和分析。

  国家兰科植质资源中心(深圳)主任刘仲健介绍,经过双方科研人员的共同努力和深入研究,目前已经完成了深圳香荚兰基因组测序工作;已经获得260Gb测序数据,基因组大小约800Mb,测序深度为325X,组装结果接近精细图标准,其中ScaffoldN50=288Kb,ContigN50=22Kb,基因数量约29000个,杂合度约1.14%,属于高杂合复杂基因组。

  国家林业局野生动植物与自然区管理司副司长刘亚文表示,项目的顺利完成为兰科植物起源和系统演化研究奠定了重要基础,为香荚兰保育研究工作和产业化提供新的突破口,有利于大力推进香荚兰乃至所有兰科植物相关产业链的发展,对加强兰科植物、兰花品种创新和提升中国在生物学、生物多样性等领域的研究水平具有重大的意义,也标志着中国兰科植物基因组测序技术的进一步成熟。(完)

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